Правовым основанием для установления прямого воздушного сообщения с Чехословакией стало межправительственное соглашение от 28 февраля 1955 года, в соответствии с которым самолеты Аэрофлота и CSA начали осуществлять полеты. В апреле 2006 Аэрофлот стал полноправным членом SkyTeam, второго по величине авиационного альянса в мире.
Флот компании является одним из самых cовременных, молодых и быстрорастущих в Европе, который насчитывает 100 авиалайнеров (большую часть составляют самолеты семейства А320, А330 и B767). В 2007 году Аэрофлот подписал крупные контракты на приобретение 22 дальнемагистральных самолетов Boeing B787 Dreamliner с началом поставок в 2016 году и 22 лайнеров Airbus A350 - в 2018.
В настоящее время Аэрофлот выполняет 3 собственных ежедневных рейса в Прагу на воздушных судах семейства А320.
Время и номера рейсов по маршруту Прага - Москва | Карловы Вары - Москва